Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTR3CQ9C0K3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTR3CQ9C0K3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTR3CQ9C0K3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTR3CQ9C0K3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTR3CQ9C0K3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms