Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABARAPL3Q9BY60 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABARAPL3Q9BY60 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABARAPL3Q9BY60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABARAPL3Q9BY60 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPL3Q9BY60 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABARAPL3Q9BY60 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPL3Q9BY60 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPL3Q9BY60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms