Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PECRQ9BY49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PECRQ9BY49 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PECRQ9BY49 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PECRQ9BY49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PECRQ9BY49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PECRQ9BY49 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PECRQ9BY49 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PECRQ9BY49 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PECRQ9BY49 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PECRQ9BY49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PECRQ9BY49 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PECRQ9BY49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms