Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM56Q9BRZ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM56Q9BRZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM56Q9BRZ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM56Q9BRZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM56Q9BRZ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM56Q9BRZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM56Q9BRZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM56Q9BRZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms