Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX2Q99697 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX2Q99697 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX2Q99697 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITX2Q99697 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PITX2Q99697 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms