Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA0

PCDHB18P, Putative protocadherin beta-18, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB18PQ96TA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB18PQ96TA0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB18PQ96TA0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB18PQ96TA0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB18PQ96TA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB18PQ96TA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB18PQ96TA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 488.9 ms