Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMF1Q96S06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMF1Q96S06 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMF1Q96S06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMF1Q96S06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMF1Q96S06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms