Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1H4Q96RI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR1H4Q96RI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR1H4Q96RI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR1H4Q96RI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR1H4Q96RI1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H4Q96RI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms