Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GSDMAQ96QA5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GSDMAQ96QA5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GSDMAQ96QA5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSDMAQ96QA5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSDMAQ96QA5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSDMAQ96QA5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GSDMAQ96QA5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSDMAQ96QA5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSDMAQ96QA5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms