Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
LRRC7Q96NW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LRRC7Q96NW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
LRRC7Q96NW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
LRRC7Q96NW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
LRRC7Q96NW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
LRRC7Q96NW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
LRRC7Q96NW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
LRRC7Q96NW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
LRRC7Q96NW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRC7Q96NW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRC7Q96NW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
LRRC7Q96NW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRC7Q96NW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms