Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRFN5Q96NI6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN5Q96NI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN5Q96NI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN5Q96NI6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN5Q96NI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRFN5Q96NI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms