Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR9

REEP6, Receptor expression-enhancing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP6Q96HR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
REEP6Q96HR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP6Q96HR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REEP6Q96HR9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP6Q96HR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REEP6Q96HR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms