Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC34Q96HJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC34Q96HJ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC34Q96HJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC34Q96HJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC34Q96HJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC34Q96HJ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC34Q96HJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC34Q96HJ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms