Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCMH1Q96GD3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCMH1Q96GD3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCMH1Q96GD3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCMH1Q96GD3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCMH1Q96GD3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms