Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF31Q96EP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF31Q96EP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF31Q96EP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF31Q96EP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms