Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY7

MTBP, Mdm2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTBPQ96DY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTBPQ96DY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTBPQ96DY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MTBPQ96DY7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTBPQ96DY7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTBPQ96DY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTBPQ96DY7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTBPQ96DY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms