Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM44Q96DX7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM44Q96DX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM44Q96DX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM44Q96DX7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM44Q96DX7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM44Q96DX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM44Q96DX7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM44Q96DX7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms