Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL29Q96CT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL29Q96CT2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL29Q96CT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL29Q96CT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL29Q96CT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL29Q96CT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms