Protein–RNA interactions for Protein: Q96A09

FAM46B, Putative nucleotidyltransferase FAM46B, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46BQ96A09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46BQ96A09 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46BQ96A09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46BQ96A09 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM46BQ96A09 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM46BQ96A09 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46BQ96A09 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46BQ96A09 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46BQ96A09 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM46BQ96A09 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM46BQ96A09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms