Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL1Q92935 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL1Q92935 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL1Q92935 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL1Q92935 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL1Q92935 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXTL1Q92935 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXTL1Q92935 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXTL1Q92935 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms