Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NELL1Q92832 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NELL1Q92832 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NELL1Q92832 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELL1Q92832 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELL1Q92832 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NELL1Q92832 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms