Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2BQ8WXI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GATAD2BQ8WXI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATAD2BQ8WXI9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATAD2BQ8WXI9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATAD2BQ8WXI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms