Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZCCHC13Q8WW36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZCCHC13Q8WW36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC13Q8WW36 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZCCHC13Q8WW36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZCCHC13Q8WW36 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZCCHC13Q8WW36 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms