Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM239Q8WW34 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM239Q8WW34 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM239Q8WW34 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM239Q8WW34 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM239Q8WW34 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM239Q8WW34 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM239Q8WW34 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms