Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GIPC2Q8TF65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GIPC2Q8TF65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GIPC2Q8TF65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GIPC2Q8TF65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GIPC2Q8TF65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GIPC2Q8TF65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GIPC2Q8TF65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms