Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCL4L1Q8NHW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL4L1Q8NHW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL4L1Q8NHW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCL4L1Q8NHW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL4L1Q8NHW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms