Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOT1L1Q8NHS2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GOT1L1Q8NHS2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOT1L1Q8NHS2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOT1L1Q8NHS2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOT1L1Q8NHS2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOT1L1Q8NHS2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOT1L1Q8NHS2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1L1Q8NHS2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms