Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PJA1Q8NG27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PJA1Q8NG27 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PJA1Q8NG27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PJA1Q8NG27 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PJA1Q8NG27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PJA1Q8NG27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms