Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIPK4Q8NE63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIPK4Q8NE63 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK4Q8NE63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK4Q8NE63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIPK4Q8NE63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.5 ms