Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND61

C3orf20, Uncharacterized protein C3orf20, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf20Q8ND61 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C3orf20Q8ND61 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C3orf20Q8ND61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C3orf20Q8ND61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C3orf20Q8ND61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C3orf20Q8ND61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C3orf20Q8ND61 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms