Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COLGALT1Q8NBJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
COLGALT1Q8NBJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COLGALT1Q8NBJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COLGALT1Q8NBJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms