Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAMD12Q8N8I0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMD12Q8N8I0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SAMD12Q8N8I0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMD12Q8N8I0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD12Q8N8I0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD12Q8N8I0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms