Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B5

PRR18, Proline-rich protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR18Q8N4B5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms