Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B5

PRR18, Proline-rich protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR18Q8N4B5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR18Q8N4B5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR18Q8N4B5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR18Q8N4B5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR18Q8N4B5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRR18Q8N4B5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms