Protein–RNA interactions for Protein: Q8N443

RIBC1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC1Q8N443 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIBC1Q8N443 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIBC1Q8N443 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIBC1Q8N443 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIBC1Q8N443 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIBC1Q8N443 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIBC1Q8N443 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIBC1Q8N443 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIBC1Q8N443 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIBC1Q8N443 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIBC1Q8N443 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIBC1Q8N443 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms