Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PROM2Q8N271 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PROM2Q8N271 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PROM2Q8N271 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PROM2Q8N271 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PROM2Q8N271 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PROM2Q8N271 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PROM2Q8N271 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PROM2Q8N271 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PROM2Q8N271 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PROM2Q8N271 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PROM2Q8N271 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PROM2Q8N271 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PROM2Q8N271 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PROM2Q8N271 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms