Protein–RNA interactions for Protein: Q8N119

MMP21, Matrix metalloproteinase-21, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP21Q8N119 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP21Q8N119 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP21Q8N119 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP21Q8N119 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP21Q8N119 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP21Q8N119 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP21Q8N119 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms