Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV8

NKAIN4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN4Q8IVV8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKAIN4Q8IVV8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKAIN4Q8IVV8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKAIN4Q8IVV8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKAIN4Q8IVV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKAIN4Q8IVV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKAIN4Q8IVV8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKAIN4Q8IVV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKAIN4Q8IVV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKAIN4Q8IVV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKAIN4Q8IVV8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NKAIN4Q8IVV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKAIN4Q8IVV8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKAIN4Q8IVV8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms