Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNGA4Q8IV77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNGA4Q8IV77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGA4Q8IV77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGA4Q8IV77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGA4Q8IV77 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGA4Q8IV77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms