Protein–RNA interactions for Protein: Q86UN3

RTN4RL2, Reticulon-4 receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RL2Q86UN3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4RL2Q86UN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4RL2Q86UN3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTN4RL2Q86UN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN4RL2Q86UN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RTN4RL2Q86UN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RTN4RL2Q86UN3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4RL2Q86UN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4RL2Q86UN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN4RL2Q86UN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms