Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM144Q7Z5S9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM144Q7Z5S9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM144Q7Z5S9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM144Q7Z5S9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM144Q7Z5S9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM144Q7Z5S9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms