Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC3Q7Z5M5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC3Q7Z5M5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC3Q7Z5M5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
TMC3Q7Z5M5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC3Q7Z5M5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC3Q7Z5M5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMC3Q7Z5M5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMC3Q7Z5M5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms