Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CLASP1Q7Z460 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CLASP1Q7Z460 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CLASP1Q7Z460 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CLASP1Q7Z460 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
CLASP1Q7Z460 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CLASP1Q7Z460 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CLASP1Q7Z460 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
CLASP1Q7Z460 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CLASP1Q7Z460 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CLASP1Q7Z460 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CLASP1Q7Z460 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CLASP1Q7Z460 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CLASP1Q7Z460 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CLASP1Q7Z460 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CLASP1Q7Z460 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
CLASP1Q7Z460 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CLASP1Q7Z460 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CLASP1Q7Z460 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CLASP1Q7Z460 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CLASP1Q7Z460 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CLASP1Q7Z460 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms