Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z419

RNF144B, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144BQ7Z419 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF144BQ7Z419 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF144BQ7Z419 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF144BQ7Z419 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF144BQ7Z419 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF144BQ7Z419 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF144BQ7Z419 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144BQ7Z419 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF144BQ7Z419 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms