Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
ZFYVE16Q7Z3T8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ZFYVE16Q7Z3T8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ZFYVE16Q7Z3T8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ZFYVE16Q7Z3T8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ZFYVE16Q7Z3T8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ZFYVE16Q7Z3T8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ZFYVE16Q7Z3T8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ZFYVE16Q7Z3T8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ZFYVE16Q7Z3T8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms