Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT7Q6ZNI0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCNT7Q6ZNI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT7Q6ZNI0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT7Q6ZNI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT7Q6ZNI0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNT7Q6ZNI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms