Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD4Q6ZMP0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THSD4Q6ZMP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THSD4Q6ZMP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THSD4Q6ZMP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THSD4Q6ZMP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THSD4Q6ZMP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms