Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C16orf54Q6UWD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf54Q6UWD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C16orf54Q6UWD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms