Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN4Q6PJG9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN4Q6PJG9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN4Q6PJG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN4Q6PJG9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms