Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM88Q6PEY1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM88Q6PEY1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM88Q6PEY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM88Q6PEY1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM88Q6PEY1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms