Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMBOX1Q6NT76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMBOX1Q6NT76 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMBOX1Q6NT76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMBOX1Q6NT76 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMBOX1Q6NT76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMBOX1Q6NT76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMBOX1Q6NT76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms